電子カルテ、レセコン、電子薬歴、保健指導システム等の導入は、業務効率化、患者様へのサービス向上、そして経営安定化に不可欠です。しかし、高額な導入コストが障壁となるケースも少なくありません。
WEMEXでは、安心してこれらのシステムを導入できるよう、最適な補助金活用プランのご提案とともに、申請もサポートいたします。
このページでは、WEMEX製品でご活用可能な補助金・助成金について、各製品ごとにまとめています。気になった方はお気軽にお問い合わせください。
WEMEX製品でご活用可能！おすすめ補助金・助成金一覧
クリニック向け製品一覧
クリニック向け電子カルテ
ハイブリッド型電子カルテシステム
デジタル化・AI導入補助金2026（通常枠）
- クリニック向け電子カルテ
- 医事コンピューター
- POSレジ
管轄組織/団体
独立行政法人中小企業基盤整備機構、中小企業庁
（事務局：TOPPAN株式会社）
（事務局：TOPPAN株式会社）
時期
1次締切分
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
金額
1プロセス以上：5万円以上150万円未満
4プロセス以上：150万円以上450万円以下
1/2以内、2/3以内※1
医療情報化支援基金（ICT基金）
- クリニック向け電子カルテ
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- クリニック向け電子カルテ
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- クリニック向け電子カルテ
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
クラウド型電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- オンライン資格確認
- クリニック向け電子カルテ
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照医事コンピューター
医事コンピューター
デジタル化・AI導入補助金2026（通常枠）
- クリニック向け電子カルテ
- 医事コンピューター
- POSレジ
管轄組織/団体
独立行政法人中小企業基盤整備機構、中小企業庁
（事務局：TOPPAN株式会社）
（事務局：TOPPAN株式会社）
時期
1次締切分
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
金額
1プロセス以上：5万円以上150万円未満
4プロセス以上：150万円以上450万円以下
1/2以内、2/3以内※1
中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- クリニック向け電子カルテ
- 医事コンピューター
- POSレジ
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- クリニック向け電子カルテ
- 医事コンピューター
- POSレジ
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
オンライン資格確認
オンライン資格確認連携ソフト
医療情報化支援基金（ICT基金）
- クリニック向け電子カルテ
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる
（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能、
電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能、
電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
事業により異なる
例：オンライン資格確認導入（診療所・電子処方箋導入）で事業額38.7万円に対し上限19.4万円（補助率1/2）電子カルテ情報共有サービス導入（大規模病院）で上限657.9万円（補助率1/2）
薬局向け製品一覧
電子薬歴
ハイブリッド型電子薬歴システム
デジタル化・AI導入補助金2026（通常枠）
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
- 生成AI薬歴入力支援サービス
管轄組織/団体
独立行政法人中小企業基盤整備機構、中小企業庁
（事務局：TOPPAN株式会社）
（事務局：TOPPAN株式会社）
時期
1次締切分
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
金額
1プロセス以上：5万円以上150万円未満
4プロセス以上：150万円以上450万円以下
1/2以内、2/3以内※1
中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
- 生成AI薬歴入力支援サービス
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
- 生成AI薬歴入力支援サービス
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
保険薬局用電子薬歴システム
デジタル化・AI導入補助金2026（通常枠）
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
独立行政法人中小企業基盤整備機構、中小企業庁
（事務局：TOPPAN株式会社）
（事務局：TOPPAN株式会社）
時期
1次締切分
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
金額
1プロセス以上：5万円以上150万円未満
4プロセス以上：150万円以上450万円以下
1/2以内、2/3以内※1
中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
医事コンピューター
保険薬局用コンピューター
デジタル化・AI導入補助金2026（通常枠）
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
独立行政法人中小企業基盤整備機構、中小企業庁
（事務局：TOPPAN株式会社）
（事務局：TOPPAN株式会社）
時期
1次締切分
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
金額
1プロセス以上：5万円以上150万円未満
4プロセス以上：150万円以上450万円以下
1/2以内、2/3以内※1
中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- 電子薬歴
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
病院向け製品一覧
病院向け電子カルテ
一般・療養型中小規模病院向け電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- 病院向け電子カルテ
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- 病院向け電子カルテ
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
病院用医事一体型電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- 病院向け電子カルテ
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- 病院向け電子カルテ
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
一の取得価格が70万円以上のソフトウェア
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
30%特別償却または7%税額控除
・資本金3000万円超の中小企業30%特別償却
生産性向上・職場環境整備等支援事業
- 生産性向上に係る製品
管轄組織/団体
厚生労働省
（自治体実施）
（自治体実施）
時期
自治体ごとにより異なるため、各自治体の最新情報をご確認ください
金額
（病院・有床診療所(※)）
許可病床数×4万円
（ 無床診療所 ）1施設×18万円
（ 訪問看護ステーション ）1施設×18万円
※許可病床数が４床以下の有床診療所は1施設×18万円を支給する
病院用医事一体型電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照
病院用医事一体型電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照
病院用電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照
精神科病院向け電子カルテシステム
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
事業により異なる（例：電子カルテ情報共有サービスは令和13年9月30日まで申請可能。電子処方箋導入補助は令和8年9月末導入完了分まで等）
金額
システム整備費用を補助
詳細は公式サイトを参照医事コンピューター
病院用医事コンピューター
デジタル化・AI導入補助金2026（通常枠）
- 電子カルテ
- 医事コンピューター
- オンライン資格確認
管轄組織/団体
独立行政法人中小企業基盤整備機構、中小企業庁
（事務局：TOPPAN株式会社）
（事務局：TOPPAN株式会社）
時期
1次締切分
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
締切日：2026年5月12日（火）17:00
4次締切分
締切日：2026年8月25日（月）17:00
申請スケジュールは公式サイトをご確認ください
金額
1プロセス以上：5万円以上150万円未満
4プロセス以上：150万円以上450万円以下
1/2以内、2/3以内 ※1
5台以下構成のMedicom-HSifソフトウェアが対象となります
中小企業経営強化税制（A類型：生産性向上設備）
- 病院向け電子カルテ
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
（ソフトウェア担当工業会：JISA 一般社団法人情報サービス産業協会）
時期
令和9年3月31日まで
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
※設備取得前に工業会証明書の申請を要す。
※証明書交付後に、お客様作業で経営力向上計画書の申請・認定書の取得を要す。
金額
即時償却または取得価格の10%
（資本金3000万円超1億円以下の法人は7%）の税額控除を選択適用中小企業投資促進税制
- 病院向け電子カルテ
- 医事コンピューター
管轄組織/団体
経済産業省 中小企業庁
時期
令和9年3月31日まで
金額
・個人事業主・資本金3000万円以下の中小企業
資本金3000万円超の中小企業
30%特別償却
・資本金3000万円超の中小企業
30%特別償却
資本金3000万円超の中小企業
30%特別償却
・資本金3000万円超の中小企業
30%特別償却
電子処方箋
電子処方箋
医療情報化支援基金（ICT基金）
- 電子処方箋
管轄組織/団体
厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金
時期
電子処方箋管理サービスの場合
令和7年10月1日から令和8年9月30日 までに完了させ、令和9年3月31日までに申請されたもの
令和7年10月1日から令和8年9月30日 までに完了させ、令和9年3月31日までに申請されたもの
金額
電子処方箋管理サービス（新機能（リフィル処方箋等）を同時導入する場合も含む。）の初期導入
135.3万円を上限に補助
※事業額の405.9万円の1/3を補助
遠隔医療システム
リアルタイム遠隔医療システム
医療施設等設備整備費補助金（遠隔医療設備整備事業）
- 生産性向上に係る製品
管轄組織/団体
厚生労働省
（自治体実施）
（自治体実施）
時期
自治体ごとにより異なるため、各自治体の最新情報をご確認ください
金額
１か所当たり、次に掲げる額の合計額とする。
１ 遠隔病理診断
(1) 支援側医療機関
(1) 支援側医療機関
１か所につき
１ 遠隔病理診断
(1) 支援側医療機関
4,598千円
(2) 依頼側医療機関14,198千円
２ 遠隔画像診断及び助言(1) 支援側医療機関
16,390千円
(2) 依頼側医療機関14,855千円
３ オンライン診療装置8,250千円
補助率２分の１１か所につき
150,000円
大学病院機能強化推進事業（経営環境の改善に資する教育研究基盤の充実）
- 生産性向上に係る製品
管轄組織/団体
文部科学省
時期
令和8年1月6日（火曜日）～令和8年2月4日（水曜日）（必着）
金額
64箇所程度×5億円程度